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【預(yù)期用途】
本產(chǎn)品就是以染料法熒光定量 PCR 技術(shù)為基礎(chǔ)開發(fā)的專門檢測的試劑盒。
【檢驗(yàn)原理】
本試劑盒可在一次反應(yīng)中快速檢測五種病原體:肺炎鏈球菌 1 型、3 型、4 型、5 型、6 型。肺炎鏈球菌的血清型分類是基于其莢膜多糖抗原結(jié)構(gòu)的差異,目前已發(fā)現(xiàn)的血清型超過 100 種。不同血清型在致病力、流行特點(diǎn)、好發(fā)人群和引起的疾病類型上存在顯著差異。1 型和 5 型是經(jīng)典的致病菌,在成人和兒童中均占有重要地位,且與膿胸等并發(fā)癥相關(guān)。3 型因其獨(dú)特的生物學(xué)特性而成為毒力最強(qiáng)的血清型,需要警惕其導(dǎo)致的高病死率。型屬于常見致病血清型,廣泛存在于各類感染中。6 型(特別是 6B)則是兒童感染的“主力軍”,且耐藥問題較為突出。根據(jù)探針法熒光定量 PCR 原理開發(fā)。
【試劑組成】
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名 稱
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規(guī) 格
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2 × Probe qPCR Mix
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700uL×1管
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ddH2O
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1 mL×1 管
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五重 qPCR 引物混合液
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2 00uL×1 管
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五重 qPCR 探針混合液
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110 uL×1 管
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五重 qPCR 陽性對照(1×10E8 拷貝/μL)
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50μL
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說明:不同批號的試劑盒組分不可交互使用。
【運(yùn)輸及保存】
避光-20±5℃保存,有效期12個(gè)月。開封后避光-20±5℃保存,對有效期沒有影響;
冰袋低溫運(yùn)輸4天、反復(fù)凍融5次對效期沒有影響。
【自備試劑】
樣品 DNA。
【適用儀器】
ABI 、安捷倫MX3000P/3005P、LightCycler、Bio-Rad、eppendorf等系列熒光定量PCR檢測儀。
【使用方法】
一、核酸提取(樣本制備區(qū))
用自選方法提取純化樣品 DNA,本試劑盒跟市場上大多數(shù)核酸提取試劑盒兼容。
二、稀釋標(biāo)準(zhǔn)曲線樣品(樣本制備區(qū))
(由于陽性對照濃度高,因此下列稀釋操作一定要在獨(dú)立的區(qū)域進(jìn)行,避免污染樣
品或本試劑盒的其他成分)。
1. 標(biāo)記 6 個(gè)離心管,分別為 7,6,5,4,3,2。
2. 用帶芯槍頭分別加入 45 μL ddH2O,(最好用帶芯槍頭,下同)。
3. 在 7 號管中加入 5 μL 1×10E8 拷貝/μL 的陽性對照(試劑盒提供),充分震蕩 1 分鐘,得 1×10E7 拷貝/μL 的標(biāo)準(zhǔn)曲線樣品。放冰上待用。
4. 換槍頭,在 6 號管中加入 5 μL 1×10E7 拷貝/μL 的陽性對照(上步稀釋所得),充分震蕩 1 分鐘,得 1×10E6 拷貝/μL 的標(biāo)準(zhǔn)曲線樣品。放冰上待用。
5. 換槍頭,在 5 號管中加入 5 μL 1×10E6 拷貝/μL 的陽性對照(上步稀釋所得),充分震蕩 1 分鐘,得 1×10E5 拷貝/μL 的標(biāo)準(zhǔn)曲線樣品。放冰上待用。
6. 重復(fù)上面的操作直到得到 6 個(gè)稀釋度的標(biāo)準(zhǔn)曲線樣品。放冰上待用。
若無需制作標(biāo)準(zhǔn)曲線,將陽性對照稀釋到 1×10E5 拷貝/μL 即可。
三、試劑配制(試劑準(zhǔn)備區(qū))
準(zhǔn)備足量的 qPCR 管(樣品管、陰性對照管、陽性對照管),向各 qPCR 管中分別加入下列成分。:
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成分
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N個(gè)
待檢樣品管
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qPCR
陰性對照管
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qPCR
陽性對照管
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2 × Probe qPCR Mix
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各 12.5 μL
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12.5 μL
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12.5 μL
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五重 qPCR 引物混合液
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各 4 μL
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4 μL
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4 μL
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五重 qPCR 探針混合液
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各2μL
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2μL
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2μL
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ddH2O
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各 4.5 μL
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4.5 μL
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4.5 μL
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轉(zhuǎn)移至模版添加區(qū)
四、添加模板(模板添加區(qū))
向 qPCR 管中分別加入 2ul 模板,順序?yàn)殛幮詫φ眨╠dH2O)、待測樣品模板、五重qPCR 陽性對照,離心 30 秒,立即進(jìn)行擴(kuò)增反應(yīng)。
五、擴(kuò)增反應(yīng)(擴(kuò)增及產(chǎn)物分析區(qū))
將 qPCR 管放置在 qPCR 擴(kuò)增儀器樣品槽相應(yīng)位置,進(jìn)行擴(kuò)增,擴(kuò)增程序如下:
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過程
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溫度
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時(shí)間
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預(yù)變性
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95℃
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3 min
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qPCR 反應(yīng)
(40 個(gè)循環(huán))
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95℃
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15sec
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60℃
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20sec
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信號通道
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同時(shí)選擇 FAM/HEX/ROX/Cy5
通道采集熒光信號
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熒光基團(tuán)和猝滅基團(tuán)選擇如下表:
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Target
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熒光基團(tuán)
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猝滅基團(tuán)
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肺炎鏈球菌 1 型
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FAM
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MGB
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肺炎鏈球菌 3 型
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HEX
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None
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肺炎鏈球菌 4 型
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ROX
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MGB
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肺炎鏈球菌5 型
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Cy5
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MGB
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肺炎鏈球菌6 型
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Cy5.5
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BHQ2
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【結(jié)果判定】
1. 如果制作標(biāo)準(zhǔn)曲線,則以陽性對照濃度的 log 值為橫軸,以 Ct 值為縱軸,繪制標(biāo)準(zhǔn)曲線。再以待測樣品的 Ct 值從標(biāo)準(zhǔn)曲線上推算出樣品 DNA 濃度的 log 值,推算出其濃度。
2. 如果未制作標(biāo)準(zhǔn)曲線,按照如下標(biāo)準(zhǔn)判定結(jié)果:
陽性對照結(jié)果:Ct 值<30,有明顯指數(shù)增長,呈典型的 S 型曲線。
陰性對照結(jié)果:Ct 值>38 或無 Ct 值,無明顯指數(shù)增長期和平臺期。
樣本檢測結(jié)果:Ct 值<35,有明顯指數(shù)增長,表明樣本中檢測出該菌種,結(jié)果為陽性;Ct 值>38 或無 Ct 值,表明樣本中未檢測出該菌種,結(jié)果為陰性;Ct 值在 35-38 范圍,應(yīng)對樣本進(jìn)行復(fù)檢,如重復(fù)實(shí)驗(yàn)結(jié)果 Ct 值仍在 35~38 范圍,有明顯指數(shù)增長,則判定為陽性,否則為陰性。
【注意事項(xiàng)】
1. 所有操作嚴(yán)格按照說明書進(jìn)行;
2. 試劑盒內(nèi)各種組分使用前應(yīng)自然融化,完全混勻并短暫離心;
3. 反應(yīng)液應(yīng)避光保存;
4. 反應(yīng)中盡量避免氣泡存在,管蓋需蓋緊;
5. 使用一次性吸頭、一次性手套和各區(qū)專用工作服;
6. 樣本處理、試劑配制、加樣需在不同區(qū)進(jìn)行,以免交叉污染;
7. 實(shí)驗(yàn)完畢后用 10%次氯酸或 75%酒精或紫外燈處理工作臺和移液器;
8. 試劑盒里所有物品應(yīng)視為污染物對待,并按照《微生物生物醫(yī)學(xué)實(shí)驗(yàn)室生物安全通則》進(jìn)行處理。
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