有一位我認(rèn)識的朋友,此人姓周,大家都稱其為老周,他從事著與分子生物學(xué)扯得上關(guān)系相匹配的工作,他在一家專門搞生物技術(shù)的公司里承當(dāng)負(fù)責(zé)產(chǎn)品研發(fā)方面給予支持的任務(wù),這份工作他已經(jīng)干了差不多快要八年的時間了。
老周這個人,做事情的時候很是踏實(shí),平常話語并不多,然而每當(dāng)談及實(shí)驗(yàn)的具體細(xì)節(jié),就能夠跟你持續(xù)不停地掰扯相當(dāng)長的一段時間。
就在上個月,我們一同去吃飯,于飯桌上,他朝著我傾訴了諸多煩心事,聲稱近期被一個項(xiàng)目嚴(yán)重困擾,而問題的根源就在于熒光定量PCR試劑盒。
情形是如此這般的。于今年年初之際,公司承接了一項(xiàng)重大訂單,此訂單要求針對客戶所提供的某一批環(huán)境樣本,去檢測其中特定基因的表達(dá)量。樣本數(shù)量并非少數(shù),存在兩百多個,又因時間緊迫,故而任務(wù)繁重。
老周承擔(dān)起搭建整個檢測體系的工作,他在一開始的時候就產(chǎn)生了這樣的想法,對于這種呈現(xiàn)大批量特性、并且要求具備精確定量的實(shí)驗(yàn)而言,熒光定量PCR試劑盒的挑選極為關(guān)鍵。
曾經(jīng),他使用數(shù)量不等的各種不同不同品牌的試劑盒,一部分試劑盒靈敏度高,還有的試劑盒表現(xiàn)為重復(fù)性良好,另外一些試劑盒價格較為實(shí)惠然而其相對穩(wěn)定性欠佳。
這回老周講,這次他可不敢輕忽大意,特地耗費(fèi)了三天時間,去比對市面上幾款主流的熒光定量PCR試劑盒的說明書誒。
后來怎么樣了呢?他挑選了一個,有著如此宣稱的,所謂“擴(kuò)增效率高、線性范圍寬”的進(jìn)口品牌。
拿到試劑盒那天,老周還挺興奮,跟同事說這次應(yīng)該能順利。
然而,現(xiàn)實(shí)很快給了他一記悶棍。
第一次預(yù)實(shí)驗(yàn),他用標(biāo)準(zhǔn)品做了標(biāo)準(zhǔn)曲線。
進(jìn)行了三次96孔板的操作,所獲取的數(shù)據(jù)令人難以理解摸不著頭腦,針對相同濃度,標(biāo)準(zhǔn)品種類的取值,Ct值在上下方向產(chǎn)生波動,超出了0.8個循環(huán)的范圍。
老周清楚,就熒光定量PCR而言,Ct值的批內(nèi)差異通常要求管控在0.3之內(nèi),而他這個數(shù)值是0.8,這是根本無法被接受的。
他首要開始懷疑的是,自己在加樣這件事情上出現(xiàn)了問題。畢竟,樣本數(shù)量多達(dá)兩百多個,依靠手工方式進(jìn)行加樣,難以避免地會產(chǎn)生誤差。
于是,他再次進(jìn)行操作,這一回,他倍加謹(jǐn)慎,針對每一個孔,他都選用了配備濾芯的吸頭,并且,他還更換了新開封的試劑。
情況仍然是那樣。關(guān)于那個試劑盒的重復(fù)性,該怎么形容呢,它如同六月的天氣,會突然發(fā)生變化。
老周這下著急了。項(xiàng)目進(jìn)度不等人,客戶那邊每周都要問進(jìn)展。
他翻出之前存下的幾個供應(yīng)商聯(lián)系方式,挨個打電話咨詢。
其中有一家國內(nèi)廠家的技術(shù)工程師,跟他聊了將近四十分鐘。
有一位工程師,他并非立即著手進(jìn)行推銷,反而是詳盡地詢問了老周,關(guān)于樣本的類型,目標(biāo)基因的具體情況,預(yù)期的表達(dá)量所涵蓋的范圍,并且還向老周提出建議,讓其針對實(shí)驗(yàn)的退火溫度開展梯度摸索。
老周說,聽到這些細(xì)節(jié),他心里大概有了數(shù)——這人懂行。
很快,對方寄來了他們家的熒光定量PCR試劑盒樣品。
老周拿到之后,依照建議再次設(shè)計了退火溫度梯度,隨后又開展了三組平行實(shí)驗(yàn)。
這回的數(shù)據(jù)讓他眼前一亮。
有一個標(biāo)準(zhǔn)品,三個進(jìn)行重復(fù)檢測的孔的Ct值,其最大的差值僅僅只有0.21。標(biāo)準(zhǔn)曲線的相關(guān)系數(shù)R2,達(dá)到了0.998 ,擴(kuò)增效率處于98%到102%之間,完美地契合了要求。
老周隨后對我講,他那時注視著電腦熒屏上的擴(kuò)增曲線,險些沒控制住抬手去拍打桌面。
連續(xù)折騰了兩周,終于看到希望了。
他趁著熱乎勁兒尚未消散,借助這全新的熒光定量PCR試劑盒,將全部兩百多個樣本逐一跑完了。
先進(jìn)行RNA提取,繼而開展反轉(zhuǎn)錄,接著到上機(jī)檢測,每一個步驟,均嚴(yán)格依照優(yōu)化之后的程序來操作。
在2026年4月12日這個時間,老周以整理完畢的狀態(tài),將最后一批數(shù)據(jù)進(jìn)行了整理,之后把這些整理出來的數(shù)據(jù)發(fā)給了客戶。
客戶那里給出反饋,結(jié)果跟預(yù)期高度相契合,并且整批數(shù)據(jù)的均一性十分良好。
周先生于公司例會上特地進(jìn)行了分享,他將此次遭遇挫折并從中擺脫困境的經(jīng)歷歸納為三條。
拿到任何一款熒光定量PCR試劑盒,不要只看說明書上的參數(shù)。
先是運(yùn)用自身所擁有的標(biāo)準(zhǔn)品去制作標(biāo)準(zhǔn)曲線,親身去驗(yàn)證線性范圍以及擴(kuò)增效率。說明書當(dāng)中表明能夠檢測到10拷貝,實(shí)際情況是否如此,唯有經(jīng)過實(shí)驗(yàn)操作跑過之后才可以知曉。
重復(fù)性差的時候,優(yōu)先排查試劑盒本身,而不是自己的操作。
很多人第一反應(yīng)是懷疑自己加樣不準(zhǔn),這是老周說的,實(shí)際上現(xiàn)在大多數(shù)實(shí)驗(yàn)室用的是電動多道移液器,加樣誤差已然很小,然而換一個批次的試劑盒,或者換一個品牌,有時問題會立刻消失。
不要迷信進(jìn)口。
以往,老周一直覺得,進(jìn)口的物品會更具穩(wěn)定性,然而,此次卻發(fā)覺,在國內(nèi),部分廠家所生產(chǎn)的熒光定量PCR試劑盒,于特定的應(yīng)用場景當(dāng)中,其表現(xiàn)并不遜色,并且,技術(shù)支撐的響應(yīng)速度較快,能夠給出具備真正針對性的建議。
此刻,老周所在的公司,業(yè)已將那個身處國內(nèi)的廠家所生產(chǎn)的熒光定量PCR試劑盒,列為了首要的供應(yīng)廠商。
每個月,他們都存在著幾百個需要開展檢測的樣本,花費(fèi)差不多一個月的時間,始終未曾出現(xiàn)過批次之間差異程度過大這樣狀況的情況與問題。
我聽完老周這段經(jīng)歷,自己也學(xué)到不少。
進(jìn)行實(shí)驗(yàn)便是如此,看上去是試劑以及耗材方面的問題,而背后常常是對于原理還有細(xì)節(jié)的理解程度。
倘若你同樣是在開展熒光定量PCR關(guān)聯(lián)的實(shí)驗(yàn),又或者正因挑選哪一個熒光定量PCR試劑盒而犯愁,那么不妨?xí)呵彝nD下來,花費(fèi)一兩天的時間去進(jìn)行一次預(yù)實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證。
別跟我那朋友老周似的,非要直等到項(xiàng)目陷入停滯狀態(tài)了,才回過頭來去尋覓問題所在。在前期多耗費(fèi)些許時間去進(jìn)行驗(yàn)證,后續(xù)整個流程就會順?biāo)煸S多。
希望老周這次的真實(shí)經(jīng)歷,能幫你少走一些彎路。






